Verwandte des Fächerblattbaumes traten zum erstem Mal im Perm auf und hatten ihre Blütezeit im Trias und Jura. Während der Kreidezeit starben die Ginkgo-Verwandten bis auf Ginkgo biloba aus. Bisland konnten rund 35 fossile Gingkoaceae nachgewiesen werden. Das Wildvorkommen liegt in China wahrscheinlich im Grenzgebiet Anhui/ Zhejiang sowie in Guizhou, kann aber aufgrund der jahrtausendelangen Anpflanzung der Art als Tempelbaum im ostasiatischen raum nicht mehr exakt nachvollzogen werden. Auch in Mitteleuropa ist die Familie fossil gut dokumentiert.